...
В случае когда используется единая учетная система «1С: Предприятие» и общая база данных, где идентификаторы элементов едины для торговой, дистрибьюторской и филиальной сети необходимо подключить в конфигурации «Агент Плюс: Управление дистрибуцией» контроль уникальности справочных данных при загрузке без учета кода дистрибьютора.
...
Для настроек параметра откройте обработку «Синхронизация данных по Т-Обмену» → «Настройка синхронизации данных по Т-Обмену» → «Агент Плюс: Т-Обмен». На вкладке «Настройка» включите флажок «Справочные данные уникальны по всем подразделениям».